当前，医疗与农业领域对抗生素的过度使用导致耐药性问题的加剧，严重威胁着公共健康。然而，现有研究主要集中在临床环境，针对病畜源大肠杆菌（尤其是其动物传人风险）的耐药性特征的研究相对较少。近期，浙江省农科院畜牧兽医所与中国科学技术大学生命科学学院的研究团队在《mBio》期刊上发表了一项新研究。该研究利用基因组技术，分析了在中国东部地区12年间收集的114株病猪源大肠杆菌的耐药性，首次发现了同时携带mcr-1和mcr-3基因的产肠毒素大肠杆菌（ETEC）菌株。

引言

畜牧养殖和医疗中抗生素的不当使用导致了“超级耐药基因”细菌的广泛传播（如blaNDM、mcr-1、tet(X4)）。这削弱了“最后一线抗生素”的疗效，且缺乏新药。大肠杆菌作为重要的人畜共患病原，既能致病又能转移耐药基因（如携带高危基因blaNDM-5、mcr-1、tet(X4/X5)），加剧了风险。全基因组测序（WGS）作为解析耐药性及致病基因的关键技术，为防控动物和人类疾病提供了重要依据。

研究结果

在本研究中，分析了2010至2021年间浙江11市82个猪场病/死猪来源的114株大肠杆菌，相关猪只表现出腹泻、脾肿大与肝肿大的症状。基因组分析显示发现39种序列类型（ST），其中ST88型最为常见，绍兴与杭州的ST多样性最高。不同年份和城市均显示多种ST型的共存，部分ST型（如ST88）在9年内持续流行，而其他（如ST117、ST48）则仅在特定时期存在。菌种鉴定结果表明菌株间小的SNP差异提示可能存在跨猪场、跨时间的传播风险。

耐药性分析

114株病猪源大肠杆菌普遍显现出严重的多重耐药性，其中99.12%的菌株对三类以上的抗生素显示耐药。对氨苄西林和复方制剂的耐药率达100%，环丙沙星和四环素的耐药率超过94%。令人关注的是，2105%菌株呈现对粘菌素的耐药。在2018年后，粘菌素的耐药率显著下降，反而F苯尼考的耐药率升至94.29%。这动态变化可能与用药政策的调整息息相关。

耐药基因组特征

针对114株病猪源大肠杆菌的基因组特征研究显示，平均携带49个质粒，其中IncFIB质粒最为常见。所有菌株均含至少2种耐药基因，80.7%的菌株携带10种以上的耐药基因，以mdf(A)、tet(A)、floR、sul2基因为主。关键发现是特定质粒与耐药基因存在强相关性，且实验证实了IncI2质粒在菌株间转移mcr-1基因的有效性。

毒力相关基因组特征

在分析的114株大肠杆菌中，所有菌株均携带至少一种毒力基因，近八成菌株携带至少10种毒力基因。terC基因最为普遍，紧接着是traT基因。分析结果显示，各特定ST型与某些毒力基因的显著关联，成功鉴定出包括产志贺毒素大肠杆菌（STEC）、产肠毒素大肠杆菌（ETEC）及产紧密素大肠杆菌（EPEC）等病原亚型。

结论

本研究揭示了浙江省病猪源大肠杆菌的高度遗传多样性及其耐药性、毒力的复杂性。特别是发现同时携带mcr-1和mcr-3基因的菌株，为耐药基因在不同质粒间的转移机制提供了新线索。生态传播风险与治疗选择需引起高度重视。同时，尊龙凯时人生就博也在持续关注抗生素耐药性问题，为建立更安全的医疗环境贡献一己之力。